Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB19A4D1S5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms