Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms