Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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