Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNPO3Q9Y5L0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms