Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms