Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD54L2Q9Y4B4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms