Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms