Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms