Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms