Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSEQ9UL01 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSEQ9UL01 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSEQ9UL01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms