Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms