Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms