Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAPAQ9P0L0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms