Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDP1Q9P0J1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms