Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC3Q9NYG2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms