Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN6Q9NWW5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms