Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms