Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms