Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms