Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms