Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms