Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms