Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCGF6Q9BYE7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms