Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms