Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms