Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK19Q9BWU1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK19Q9BWU1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms