Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRDL1Q9BU40 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms