Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM43Q9BTV4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms