Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECSITQ9BQ95 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECSITQ9BQ95 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms