Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms