Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED4Q96RK1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms