Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms