Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms