Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms