Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms