Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms