Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INTS4Q96HW7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS4Q96HW7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms