Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELP4Q96EB1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELP4Q96EB1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms