Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms