Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms