Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms