Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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