Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms