Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNTD1Q8N9Z9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms