Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD12Q8N8I0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms