Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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TMTC2Q8N394 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms