Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD35Q8N283 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD35Q8N283 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms