Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CATSPER4Q7RTX7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CATSPER4Q7RTX7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms