Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOM1L2Q6ZVM7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOM1L2Q6ZVM7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms