Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf139Q6ZV77 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms